OpenCppCoverage の --sources オプションには 終端記号や完全一致を強制する仕組みはありません。中間一致 (部分一致) で動作する仕様になっています。
a.c と a.cc が存在する場合、--sources=a.c と指定すると a.cc もマッチしてしまいます。
a.c だけを対象にして a.cc を除外したい場合、以下の方法が使えます。
ファイルがディレクトリ構造で区別できる場合、パスを含めて指定します。
--sources=src\a.c
これで src\a.cc は除外されます。
--excluded_sources で除外するa.c を含めつつ、a.cc を明示的に除外します。
--sources=a.c --excluded_sources=a.cc
--excluded_sources は --sources より優先されるため、a.cc がマッチしても除外されます。
複数ファイルがある場合、ワイルドカードと除外を組み合わせます。
--sources=*.c --excluded_sources=*.cc
.c 拡張子のみを対象にし、.cc を除外できます。
$ など) は使えません。\ (Windows) で記述します。--sources や --excluded_sources を並べて使えます。この制約により、ファイル名の設計段階で区別しやすい名前を付けておくか、上記の回避方法を使って対処する必要があります。